Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Puf60Q3UEB3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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