Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms