Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Kdm4dQ3U2K5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms