Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms