Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms