Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms