Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rtl9Q32KG4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rtl9Q32KG4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rtl9Q32KG4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtl9Q32KG4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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