Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms