Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VgfQ0VGU4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms