Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms