Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NrepQ07475 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms