Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms