Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms