Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NfiaQ02780 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NfiaQ02780 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NfiaQ02780 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NfiaQ02780 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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