Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GscQ02591 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms