Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms