Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms