Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms