Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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