Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms