Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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