Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Lsm6P62313 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lsm6P62313 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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