Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Rps29P62274 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms