Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms