Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn18P56857 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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