Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp5bP56480 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms