Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab4aP56371 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab4aP56371 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab4aP56371 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab4aP56371 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab4aP56371 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab4aP56371 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab4aP56371 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab4aP56371 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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