Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp10P52479 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp10P52479 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms