Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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