Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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