Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc10P31257 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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