Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
RxraP28700 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RxraP28700 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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