Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BgnP28653 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BgnP28653 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BgnP28653 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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