Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa2P28309 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms