Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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