Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms