Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PdgfaP20033 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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