Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18533 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18533 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18533 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms