Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
P18530 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
P18530 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
P18530 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
P18530 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
P18530 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P18530 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P18530 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms