Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms