Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01661 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01661 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01661 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms