Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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