Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms