Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Csnk2a2O54833 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk2a2O54833 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms