Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CrxO54751 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CrxO54751 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms