Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms