Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms