Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm3415J3QMS8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm3415J3QMS8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm3415J3QMS8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms