Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r34G3XA52 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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