Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm28048F7BCN0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm28048F7BCN0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm28048F7BCN0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm28048F7BCN0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm28048F7BCN0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm28048F7BCN0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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